O Laboratório de Ecofisiologia e Toxicologia de Cianobactérias tem desenvolvido pesquisas sobre:
Ocorrência de cianobactérias tóxicas em ecossistemas aquáticos brasileiros;
Influência de fatores ambientais no crescimento e produção de toxinas por cianobactérias;
Isolamento e manutenção de linhagens de cianobactérias em coleções de culturas;
Extração, purificação e quantificação de cianotoxinas por métodos cromatográficos, imunológicos e enzimáticos;
Avaliação dos processos de bioacumulação de cianotoxinas pela biota aquática e suas conseqüências ambientais e para a saúde pública;
Eficiência de processos de tratamento da água na remoção de células viáveis de cianobactérias e suas toxinas;
Efeitos fisiológicos e toxicológicos da exposição crônica a cianotoxinas em peixes e mamíferos;
Estudos "omicos" (genômicos, proteômicos e metagenômicos) com linhagens de cianobactérias, buscando identificar fatores ambientais relacionados com a síntese de cianotoxinas e sucesso adaptativo das cianobactérias;
Efeitos da intensidade luminosa e concentração de nutrientes na produção de biomassa e produção de lipídeos por microalgas.